A principal diferença está na forma como a instituição se conecta ao sistema financeiro do Banco Central.
No Pix direto, a instituição possui conexão própria com o SPI e realiza processamento das transações diretamente.
Já no Pix indireto, a empresa depende de uma instituição participante direta para intermediar comunicação e processamento das operações Pix.
Enquanto o modelo direto oferece maior autonomia operacional, o modelo indireto reduz complexidade regulatória e tecnológica para empresas que desejam operar com Pix.